Monumento nacional classificado desde 1921, o templo hebraico é um dos monumentos mais visitados de Tomar. O edifício deve ter sido construído no final da primeira metade do século XV, tendo sido o único edificado para o efeito em Portugal que chegou aos nossos dias.

Financiada  por  uma elite  de  judeus,  próximos  da  Ordem de Cristo e da família real que a administrava, a construção da Sinagoga seguiu de muito perto o estilo gótico e estava perfeitamente integrada  nos  sítios  usuais  para  as  casas  de  oração  dos  judeus:  um  local recolhido a meio da judiaria.

Após o édito de expulsão dos judeus, o edifício da Sinagoga foi transformado em cadeia do concelho e, mais tarde, em ermida da invocação de S. Bartolomeu.  No Séc. XIX chegou a funcionar como celeiro e armazém de mercearias.

Apesar da classificação como monumento em 1921, só dois anos depois é que Samuel Schwarz, judeu polaco investigador da Cultura Hebraica, a salvaria do estado caótico em que se encontrava, adquirindo-a e recuperando-a, tendo vindo a doá-la, em 1939, ao Estado Português para a instalação do Museu Luso-Hebraico Abraão Zacuto.