Vestígios da construção primitiva fazem remontar a origem desta Quinta, importante testemunho do passado rural do concelho, ao século XVIII. Pertenceu à família Santos Fernandes. Em 1997 a Quinta Nova da Atalaia foi doada à Câmara Municipal de Montijo.

Hoje alberga o primeiro núcleo museológico dedicado à temática agrícola do concelho – o Museu Agrícola.

Explorando a componente pedagógica, a Quinta conserva alfaias e equipamentos característicos da casa agrícola de outrora, nomeadamente: lagar, adega, charrua, alambique, integrados no contexto rural que uma horta e um pomar avivam.